Информатика в науке об углеводах
(аннотация и иллюстрации к докладу; редакция 2024)

Скачать комплект слайдов в высоком разрешении (PDF, 10 Мб)

Glycoinformatics В неадаптированном виде похожий доклад был представлен на защите докторской диссертации по специальности "Биоорганическая химия" 22.05.2019:
Диссертация (доклад, слайды, аннотация, автореферат, документы, обновления 2021, и т.д.)

Аннотация

Углеводы - один из важнейших и наиболее разнообразный класс биомакромолекул. Они определяют процессы межклеточного узнавания, формирования иммунитета и управляют множеством других сигналов в живых организмах. В отличие от ситуации в других науках о жизни использование информационных технологий в гликомике долгое время находилось в зачаточном состоянии, и лишь в последние десять лет произошло взрывное развитие новой области знания - гликоинформатики. Тем не менее проекты гликобиологии плохо совместимы друг с другом и имеют недостатки, обусловленные сложностью и вариативностью природных углеводов. При этом накоплен огромный объем данных, и для того, чтобы в нем ориентироваться, химикам и биологам необходимы современые инструменты информатики - базы данных, прогностические программы, стандарты и форматы данных, способы кодирования, ввода и визуализации информации, правила анализа и создания публикаций.

Группа гликоинформатики ИОХ проводит систематическую работу по информатизации гликомики. Сформированы критерии качества программ и сервисов в этой области, созданы стандарты и онтологии компьютерного представления углеводных данных, разработаны тематические базы данных и расчетные модули. В рамках проекта Carbohydrate Structure Dadatbase (CSDB) разработан продукт, аккумулировавший новейшие технологии гликоинфоорматики, собственные усилия по анализу накопленных данных и достижения конкурентов. За 20 лет своего существования он стал наиболее популярным мировым источником данных по углеводам микроорганизмов. Ключевые особенности входящих в него баз данных - это полнота покрытия, полностью верифицируемый контент и регулярное обновление. Как платформа CSDB содержит множество свободно доступных сервисов углеводной тематики, включая конформационные расчеты, моделирование спектров ЯМР и установление структуры по спектрам, углеводную фенетику и другие. Все возможности проекта бесплатно доступны ученым через Интернет (http://csdb.glycoscience.ru).

Список слайдов
(нажмите на название для быстрого перехода)

Слайды


ScienceДом : Наука NMRНаука : CSDB CoursesДом : Преподавание

Последнее обновление: 2024 апрель 17      Домой